《肠球菌比较基因组学》
作者:
钟智
出版日期:
2026-03-01
字数:
318000
开本:
16开
页数:
220
分类:
生物
ISBN:
978-7-5184-5395-5
定价:
¥88.00
官网优惠价格:
¥70.4
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内容简介
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图书目录
绪论
参考文献
第一章 肠球菌属的比较基因组分析
第一节 肠球菌属的一般基因组特征
第二节 肠球菌属的系统发育和进化
第三节 肠球菌属的碳水化合物代谢
第四节 肠球菌属的抗生素耐药性
参考文献
第二章 粪……绪论
参考文献
第一章 肠球菌属的比较基因组分析
第一节 肠球菌属的一般基因组特征
第二节 肠球菌属的系统发育和进化
第三节 肠球菌属的碳水化合物代谢
第四节 肠球菌属的抗生素耐药性
参考文献
第二章 粪肠球菌的比较基因组分析
第一节 粪肠球菌
一、粪肠球菌简介
二、细菌的耐药基因、毒力因子和前噬菌体序列
三、比较基因组学在肠球菌研究中的应用
第二节 粪肠球菌的比较基因组分析: 对其环境适应性的见解
一、粪肠球菌的一般基因组特征
二、粪肠球菌的泛基因组和核心基因组
三、粪肠球菌的系统发育分析
四、粪肠球菌的环境特异性基因
五、粪肠球菌的耐药基因
六、粪肠球菌的毒力因子
七、粪肠球菌的前噬菌体序列
第三节 不同分离源粪肠球菌的毒力因子比较
一、粪肠球菌毒力因子的鉴定
二、毒力因子拷贝数分析
三、毒力因子在基因组中的分布情况
四、粪肠球菌共有的毒力因子分析
五、不同分离源粪肠球菌所含毒力因子
六、环境特异性毒力因子
第四节 基于全基因组关联分析研究粪肠球菌发酵食品分离株的耐药性
一、粪肠球菌耐药性结果
二、与耐药性相关的基因
三、基因SecG的缺失与菌株的耐药性
第五节 基于比较基因组学技术研究粪肠球菌乳源分离株的安全性
一、粪肠球菌基因组信息
二、粪肠球菌平均核苷酸一致性分析
三、粪肠球菌核心基因集和泛基因集
四、粪肠球菌系统发育树的构建
五、粪肠球菌的耐药基因
六、粪肠球菌的毒力因子的编码基因
七、可移动遗传元件
参考文献
第三章 屎肠球菌的比较基因组分析
第一节 屎肠球菌
第二节 比较基因组学分析揭示屎肠球菌基因组的可塑性和环境适应性
一、屎肠球菌基因组的一般特征
二、屎肠球菌的泛基因组和核心基因组
三、屎肠球菌的系统发育分析
四、屎肠球菌的耐药基因
五、屎肠球菌的毒力因子
六、屎肠球菌的环境特异性基因
第三节屎肠球菌乳源分离株抗生素耐药性的全基因组关联研究
一、屎肠球菌乳源分离株的耐药表型
二、屎肠球菌的一般基因组特征
三、屎肠球菌的ANI分析
四、屎肠球菌的核心基因和泛基因
五、屎肠球菌的系统发育分析
六、屎肠球菌毒力因子分析
七、屎肠球菌耐药基因分析
八、全基因组关联分析鉴定潜在的耐药基因
参考文献
第四章 乳酸肠球菌的比较基因组分析
第一节 乳酸肠球菌
一、乳酸肠球菌简介
二、乳酸肠球菌的致病性因素
三、全基因组关联分析
第二节 乳酸肠球菌乳源分离株的耐药表型
第三节 乳酸肠球菌的一般基因组特征、 泛-核基因组
及系统发育树的构建
一、一般基因组特征
二、核心基因组和泛基因组
三、乳酸肠球菌系统发育树的构建
第四节 乳酸肠球菌基因组中的毒力因子
第五节 乳酸肠球菌基因组中的耐药基因及GWAS分析鉴定潜在的耐药基因
一、乳酸肠球菌的耐药基因
二、利用GWAS分析鉴定潜在耐药表型编码基因
参考文献
附录
附表 1 粪肠球菌环境特异性基因列表
附表 2 粪肠球菌耐药基因列表
附表 3 完整前噬菌体区在粪肠球菌菌株中的分布
附表 4 通过Scoary鉴定出潜在的抗生素抗性基因
附表 5 乳酸肠球菌对15种抗生素的MIC分布结果
附表 6 通过Scoary分析在60株乳酸肠球菌中鉴定出潜在的抗生素抗性基因
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